北海道・函館の斧江財閥に怪盗キッドの予告状が届いた！狙いは新選組の副長・土方歳三に関係する刀。ビッグジュエルを追うキッドがなぜ？剣道大会に出る服部平次の応援で函館に来ていたコナンも現場へ。ある恨みに燃えている平次はキッドを追い詰め…。さらに刀による殺人事件が発生、捜査線上にあがったのは「死の商人」と呼ばれる男。斧江家初代当主が隠したとされる宝を探しているらしい。キッドが狙う刀とも関係があるようで…。お宝争奪戦勃発にコナンは！？中学年から。