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タイトル |
再現可能性のすゝめ(サイゲンカノウセイノススメ) |
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データ解析とレポート作成の再現性を高めよう。その先には、ボスの笑顔が待っている。
RStudioを使いこなそう。その先には、旨いお鮨が待っている。
Rマークダウンをマスターしよう。その先には、明るい未来が待っている。
本書はRによる再現可能なデータ解析とレポート作成を身につけるための一冊である。
Rがデータ解析のデファクトスタンダードとなった現在,Rの使い方やRによるさまざまなデータ解析手法についての情報は数多く入手できる。しかしどれだけ立派なデータ解析であっても,結果が再現できなかったり,間違いだらけだったり,時間がかかりすぎて完成しなかったりしたら,価値は半減である。
本書ではRStudioとRマークダウンについての解説を通して,再現性と信頼性を高め効率を上げるような「データ解析とレポート作成というプロセス」について解説している。データ解析に携わるすべての人に,再現可能性の意義を学び,RStudioとRマークダウンによる再現可能なデータ解析とレポート作成を日々の習慣としてほしい。
Chapter 1 再現可能性のすゝめ
1.1 アドホックなデータ解析とその問題点
1.2 Rスクリプトの導入とその問題点
1.3 再現可能なデータ解析とその問題点
1.4 Rマークダウンによる再現可能なレポート作成
1.5 再現可能なデータ解析とレポート作成のメリット
Chapter 2 RStudio入門
2.1 RStudioとは
2.2 RStudioのダウンロードとインストール
2.3 はじめてのRStudio
2.4 まずはRStudioを動かしてみよう
2.5 RStudioでの作業パターン
2.6 タブの紹介
2.7 ツールバー
2.8 メニューバー
2.9 Windowsでの日本語の利用
Chapter 3 RStudioによる再現可能なデータ解析
3.1 Rスクリプトによる解析
3.2 はじめてRスクリプトを使うためのチュートリアル
3.3 プロジェクト機能を利用する
3.4 データの読み込みの自動化
3.5 解析結果の保存の自動化
Chapter 4 RStudioによる再現可能なレポート作成
4.1 再現可能なレポートづくりを目指そう
4.2 Rマークダウンによるレポート作成:最初の一歩
4.3 コードの記述と動作の制御
4.4 ドキュメントの記述
4.5 YAMLヘッダによるレポートのメタデータ設定
4.6 レポート作成の実行
4.7 Rマークダウン編集サポートツール
4.8 Rスクリプトからレポート作成
Chapter 5 Rマークダウンによる表現の技術
5.1 さまざまな形式のレポート作成
5.2 bookdownによる書籍の作成
5.3 flexdashboardでエッセンスを伝える
5.4 htmlwidgetsによるインパクトのある可視化
5.5 表を極めるー正確さと効率の両立
5.6 文献目録の作成
Chapter 6 再現可能性を高める
6.1 バージョン管理システムによる解析プロジェクトの管理
6.2 再現できる環境づくり:packrat編
6.3 パラメータ付きRマークダウン
6.4 R以外の言語エンジンの利用
6.5 外部のRマークダウンとRスクリプトの読み込み
6.6 Rマークダウンで後ろ向き参照
Chapter 7 RStudioを使いこなす
7.1 RStudioのオプション
7.2 コード補完機能
7.3 コードスニペット
7.4 コードの診断
7.5 RStudioによるデバッグ
付録A マークダウン記法
付録B チャンクオプション
索引