地球の先住民族によって、改造・蘇生されたカメラマン・瀬川耕司が仮面ライダーJとなった。彼はかつて地球に氷河期をもたらし恐竜を絶滅に追いやった巨大機械怪獣母艦フォッグ・マザーと戦う。