平和な地球に再び怪獣たちが攻撃を仕掛けてきた。GUYSの隊長となったリュウは反撃するが、異空間に引きずり込まれ、黒い巨人と遭遇し……。TVシリーズと同じキャストで贈る『ウルトラマンメビウス』の外伝。